Es gab da keine Änderung. Die Verwirrung darüber entsteht meist dann, wenn nicht zwischen direkt wirkenden und langwirkenden Zaubern unterschieden wird.
Die direkt wirkenden Zauber (also Seesturm, Zeus' Zorn und Weisheit) können so oft auf ein und denselben Angriff gewirkt werden, wie es die Gunstproduktion des Angegriffenen erlaubt. Gerade bei langen Laufzeiten kann man sich als Angreifer da also mehrere dieser Schadzauber einfangen.
Hingegen können die langwirkenden Zauber (also Sehnsucht, Günstiger Wind, Heldenkraft, Rückkehr aus der Unterwelt, Helm der Unsichtbarkeit) nur einmal auf einen Angriff gewirkt werden. Dabei ist es irrelevant, ob der langwirkende Zauber vom Angreifer zum Schutz seiner Truppen (Günstiger Wind, Heldenkraft, Rückkehr aus der Unterwelt, Helm der Unsichtbarkeit) oder vom Angegriffenen zu deren Schaden (Sehnsucht) gewirkt wurde.
Legt der Angreifer also sofort nach dem Absenden einen Schutzzauber auf seine Truppen, kann der Angegriffene keinen Schadzauber mehr auf sie wirken, egal ob direkt oder langfristig wirkend. (Dies gilt für normale Welten, für Heldenwelten nur eingeschränkt).
Schützt der Angreifer seine Truppen hingegen nicht sofort durch einen langwirkenden Zauber, wird der Angegriffene normalerweise erst Weisheit auf den Angriff wirken, und kann dann, wenn er es für notwendig hält, nacheinander weitere direkt wirkende Zauber auf den Angriff legen, also etwa Seesturm und Zeus´Zorn, so oft die vorhandene Gunst es während der Laufzeit zulässt - und könnte zuguterletzt dann auch noch einen langwirkenden Zauber (Sehnsucht) hinterherschieben. Es ist also dringend zu empfehlen, dass der Angreifer die wichtigsten Angriffe sofort nach dem Absenden mit eigenem langwirkenden Zauber schützt, um dem zu entgehen; allerspätestens aber dann, wenn das "Opfer" den ersten direkt wirkenden Zauber auf den Angriff gewirkt hat und somit zeigt, dass es aktiv ist und sich zu wehren gedenkt.
Bei Deinem Beispiel mit dem Seesturm war damals genau das passiert: Nach dem ersten Seesturm, den Du gewirkt hattest, hat der Angreifer dann einen Schutzzauber auf seinen Angriff gelegt, um Dich am Nachlegen zu hindern. Daher kam bei Deinem zweiten Versuch die Meldung, dass bereits ein Zauber gewirkt wurde,